L’aspetto cruciale della preparazione del cacciucco alla livornese è quello relativo ai diversi tempi di cottura dei vari pesci utilizzati.
Infatti, poiché, come abbiamo meglio spiegato nella sezione delle principali varianti, devono essere impiegati diversi tipi di pesci, ognuno dei quali ha un diverso tempo di cottura (molto lungo per il polpo, lungo per seppie e calamari, abbastanza breve per i pesci in tranci, un po’ più breve per i pesci da minestra più grossi, breve per i pesci da minestra più piccoli, molto breve per i crostacei e le cozza), è fondamentale che ognuno cuocia per il giusto tempo.